Análisis de genomas obtenidos a partir de metagenomas dentro del filo Chloroflexi provenientes de tapetes microbianos de fuentes termales de Costa Rica utilizando herramientas bioinformáticas /

Analiza genomas ensamblados a partir de metagenomas clasificados dentro del filo Chloroflexi obtenidos a partir de tapetes microbianos de fuentes termales de Costa Rica utilizando herramientas bioinformáticas para la identificación de posibles genes termotolerantes. Esta investigación tuvo como o...

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Bibliographic Details
Main Author: Agüero Rojas, Kimberly (autora)
Corporate Author: Universidad Nacional (Costa Rica). Escuela de Ciencias Biológicas. Licenciatura en Biotecnología
Other Authors: Uribe Lorío, Lorena (supervisor de grado), Brenes Guillén, Laura (lectora de grado), Solano González, Stefany (lectora de grado)
Format: Thesis
Language:Spanish
Published: Heredia, Costa Rica : K. Agüero R., 2022.
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/11056/23379
Description
Summary:Analiza genomas ensamblados a partir de metagenomas clasificados dentro del filo Chloroflexi obtenidos a partir de tapetes microbianos de fuentes termales de Costa Rica utilizando herramientas bioinformáticas para la identificación de posibles genes termotolerantes. Esta investigación tuvo como objeto de estudio 74 MAGs dentro del filo Chloroflexi provenientes de 14 fuentes termales de Costa Rica. Estos MAGs fueron ensamblados previamente por el equipo de investigación de Microbiología Ambiental del Centro de Investigación de Biología Molecular y Celular, Universidad de Costa Rica. Los sitios de estudio correspondieron a 14 tapetes microbianos de fuentes termales con rangos de temperatura entre 35 °C y 75 °C. Los MAGs fueron generados mediante el binning de metagenomas. Se identificaron 10 genes los cuales forman parte del sistema de chaperonas, los cuales participan en el metabolismo energético y en la reparación del ADN. En este estudio, se identificaron seis clases del filo Chloroflexi, contribuyendo al conocimiento de este filo a nivel de diversidad y distribución en los tapetes microbianos de fuentes termales de Costa Rica. A partir de los resultados obtenidos, se sugiere una nueva diversidad del filo en estos ambientes, ya que el análisis filogenómico resulta en la presencia de clados distintos a los reportados en la literatura.
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