| Sumario: | Este estudio consistió en la exploración de la diversidad de géneros de hongos endófitos en hojas de café en once fincas de la provincia de Chiriquí (Río Sereno). Se obtuvieron 927 aislamientos fúngicos los cuales fueron agrupados en 192 morfotipos. Mediante la técnica de microcultivo, microscopía y el uso de claves taxonómicas, se identificó los siguientes géneros: Collectotrichum sp. con un 60.51%, Tritirachium sp. 0.86%, Penicilium sp. y Aspergillus sp. 0.53%, Nigrospora sp, Hyalodendro sp y Bipolaris sp. 0.10%. El 17.69% de los especímenes fue catalogado mycelia sterilia por presentar micelio sin esporas. El resto de los especímenes representando un 19.52 % no fue identificado. Collectotrichum sp. fue el hongo predominante en todas las fincas. Mediante pruebas de antagonismo dual entre Collectotrichum sp. y Trichoderma sp. disponibles en el Laboratorio de Biotecnología Microbiana, se determinó que dos cepas (Trichoderma sp. 01 y 06) inhibieron notablemente a Collectotrichum sp. a través del mecanismo de micoparasitismo. Esto justifica la evaluación adicional de estas cepas de Trichoderma con la finalidad de su posible aplicación en el control biológico de patógenos del café.
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